"Организация и технология защиты информации" - область науки и техники, охватывающая совокупность проблем, связанных с организацией и технологией защиты на объектах информатизации. 
Объектами профессиональной деятельности специалиста по защите информации являются правовое обеспечение, организация и эксплуатация систем и средств обеспечения защиты информации на объектах информатизации. 
Специалист по защите информации выполняет сложные работы, связанные с обеспечением комплексной защиты информации на основе разработанных программ и методик. Проводит сбор и анализ материалов учреждений, организаций и предприятий отрасли с целью выработки и принятия решений и мер по обеспечению защиты информации и эффективному использованию средств автоматического контроля, обнаружения возможных каналов утечки сведений, представляющих государственную, военную, служебную и коммерческую тайну. Анализирует существующие методы и средства, применяемые для контроля и защиты информации, и разрабатывает предложения по их совершенствованию и повышению эффективности этой защиты. Участвует в обследовании объектов защиты, их аттестации и категорировании. Разрабатывает и подготавливает к утверждению проекты нормативных и методических материалов, регламентирующих работу по защите информации, а также положений, инструкций и других организационно-распорядительных документов. Организует разработку и своевременное представление предложений для включения в соответствующие разделы перспективных и текущих планов работ и программ мер по контролю и защите информации. Дает отзывы и заключения на проекты вновь строящихся и реконструируемых зданий и сооружений и другие разработки по вопросам обеспечения защиты информации. Участвует в рассмотрении технических заданий на проектирование, эскизных, технических и рабочих проектов, обеспечивает их соответствие действующим нормативным и методическим документам, а также в разработке новых принципиальных схем аппаратуры контроля, средств автоматизации контроля, моделей и систем защиты информации, оценке технико-экономического уровня и эффективности предлагаемых и реализуемых организационно-технических решений.

Научная база подготовки – научно-исследовательская лаборатория компьютерной безопасности. Открыта приказом ректора в 1999 г.

Направления научных исследований – прикладная дискретная математика (с конца 1950-х гг.), криптография (с середины 1960-х гг.), анализ безопасности компьютерных систем (с конца 1990-х гг.).

Организация научных мероприятий – Сибирская научная школа-семинар с международным участием «Компьютерная безопасность и криптография». Проводится кафедрой ежегодно в сентябре на базе вузов и научных учреждений городов Сибири.

Техническая база подготовки – 3 компьютерных класса, физическая лаборатория, лаборатория электроники и схемотехники, лаборатория технических средств защиты информации, студенческая учебно-исследовательская лаборатория компьютерной безопасности.

Места прохождения преддипломной практики и дипломирования – кафедра  компьютерной безопасности (ТГУ), управление информатизации (ТГУ), управление безопасности СХК (Северск), банки и налоговые службы (Томск), НПО «Информзащита» (Москва), фирмы Элекард, Элеси, Томлайн, НИПИНефть, Томсктрансгаз (Томск) и др.

Места работы выпускников: органы государственной власти, Федеральная служба безопасности, учебные заведения и научные организации, отделы безопасности банков, налоговых органов, предприятий.

«Криптография – очень сложная математическая дисциплина. Возможно, самая сложная. Из 100 человек, обучающихся криптографии, получается максимум 5 настоящих специалистов. Остальные идут в отвал. Из них вырастают программисты, разнопрофильные математики, но не математики-криптографы».

Е.В. Касперский.

Есть аспирантура по специальности 05.13.19 «Методы и системы защиты информации, информационная безопасность».

Издается научный журнал «Прикладная дискретная математика», ориентированный на публикации результатов научных исследований в области компьютерной безопасности и криптографии, включая результаты НИР студентов и аспирантов.

Открыта школа юного криптографа для подготовки учащихся школ к поступлению в ТГУ на специальность «Компьютерная безопасность».

Основу программистского образования по специальности КБ составляет свободное программное обеспечение на базе LINUX.